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许多药物结合于特异性大分子或与其相互作用而产生药理效应，这些大分子通常是位于细胞表面或细胞内的复合蛋白质。某几类药物可直接与内源性或外源性非蛋白质<医学教育网收集整理>类起作用，这些药有：与核酸相互作用的某些抗癌药，金属螯合剂（如依地酸钙钠，二巯丙醇，去铁胺）以及化学性中和胃酸的抗酸药。
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