治疗直接针对垂体功能减退的靶腺激素替代治疗已在手册这一节和其他部分相关章节中讨论。成人GH缺乏不必处理。
当垂体功能减退由于垂体肿瘤，特殊处理必须针对肿瘤及激素替代治疗。这些肿瘤的恰当处理有争论，如肿瘤小，不分泌PRL.大多支持经蝶肿瘤切除。大多数内分泌学者任其肿瘤大小，主张溴隐停作催乳素瘤的起始治疗（见下文）。有证据指出，＞2cm大的腺瘤伴有极高催乳素血症病人，除了溴隐停治疗外，需要外科和放射治疗。同样可用超高压治疗。大的肿瘤向鞍上扩散，经额或进蝶完全切除肿瘤已不可能，可采用超高压放疗。外科治疗和放射后可以丧失其他垂体激素功能。放射病人可在数年中逐渐丧失内分泌功能，也可由于视交叉纤维化出现视力障碍。此外，治疗后激素水平应需反复评估，开始最好在3和6个月，然后每年测定。如何更完善地评估有一些问题，但必须评估甲状腺和肾上腺功能以及X线蝶鞍评估和视野检查。
垂体卒中，如有视野障碍或动眼神经突然麻痹，或如因下丘脑压迫，嗜睡渐至晕迷，应立即外科治疗。虽然大剂量皮质激素内科治疗和一般支持对少数病例已足够，但作为出血性肿瘤常规进蝶减压应立即进行。
