牙源性囊肿主要来源于牙体组织在发育和形成过程中涉及的上皮组织，下面为你详细阐述其来源情况。

牙源性囊肿根据其发生过程可分为发育性和炎症性两大类，不同类型有不同的上皮来源。

发育性牙源性囊肿中，含牙囊肿是较为常见的一种。它的上皮来源是缩余釉上皮，当牙冠形成后，缩余釉上皮与牙面之间会有液体渗出和蓄积，进而形成含牙囊肿。一般囊肿内含有一颗牙齿，多发生于下颌第三磨牙等部位。萌出囊肿也属于发育性牙源性囊肿，它的上皮同样来自缩余釉上皮，是正在萌出的乳牙或恒牙的缩余釉上皮与釉质之间液体潴留而形成，通常会影响牙齿的正常萌出。

另一种发育性牙源性囊肿是牙源性角化囊肿，其上皮来源为牙板残余。牙板在牙齿发育过程中会逐渐退化消失，但如果有残余上皮细胞留存，就可能发展成牙源性角化囊肿。该囊肿具有一定的侵袭性和较高的复发率。

炎症性牙源性囊肿主要指根尖周囊肿，它是最常见的牙源性囊肿之一。根尖周囊肿的上皮来源是Malassez上皮剩余，当牙齿发生龋坏等病变，导致牙髓感染坏死，炎症刺激根尖周组织，Malassez上皮剩余在炎症因子的作用下增生，形成上皮团，上皮团中央发生液化变性，周围组织液不断渗出，逐渐形成囊肿。

综上所述，牙源性囊肿主要来源于缩余釉上皮、牙板残余以及Malassez上皮剩余等牙体发育相关的上皮组织，不同来源导致了不同类型牙源性囊肿的发生。