由于你没有明确指出“两者”具体是什么，下面我以口腔常见的两种疾病——牙源性角化囊肿和含牙囊肿为例，为你阐述它们的病理特征区别。

牙源性角化囊肿又称始基囊肿，其病理特征具有独特性。在肉眼观察方面，囊肿壁较薄，囊腔内常含有黄白色发亮的角化物或干酪样物质，有时还会呈淡黄色或血性液体。镜下可见，衬里上皮为较薄的、厚度一致的复层鳞状上皮，常由5 - 8层细胞组成，一般没有上皮钉突。上皮表面呈波浪状或皱褶状，表层角化多呈不全角化。棘细胞层较薄，细胞内水肿，基底层细胞呈柱状或立方状，细胞核远离基底膜，呈栅栏状排列。纤维囊壁较薄，一般无炎症，但合并感染时，纤维组织会出现炎症细胞浸润，上皮可发生不规则增生。此外，纤维囊壁内有时可见微小的子囊和（或）上皮岛。

含牙囊肿又称滤泡囊肿，是指囊壁包含一个未萌牙的牙冠并附着于该牙的牙颈部的囊肿。肉眼观察，囊肿内含牙冠，囊壁附着于牙颈部，囊液多为淡黄色透明液体，含胆固醇结晶。镜下，衬里上皮为复层鳞状上皮，一般较薄，由2 - 5层扁平细胞或矮立方状细胞组成，无角化，无上皮钉突。纤维囊壁较薄，无明显炎症，有时可见牙源性上皮岛或皮脂腺细胞。当发生感染时，上皮增生，钉突明显，囊壁内有大量炎症细胞浸润。

综上所述，牙源性角化囊肿和含牙囊肿在衬里上皮的厚度、角化情况、细胞形态、基底细胞排列，以及纤维囊壁的特征等方面都存在明显的病理特征区别，这些区别对于准确诊断和治疗这两种疾病具有重要意义。