牙源性颌骨囊肿的诊断主要依据患者的病史、临床表现以及相关的辅助检查，以下从这几个方面详细阐述。

在病史方面，要详细询问患者的口腔情况，比如是否有牙齿龋坏、牙外伤、拔牙史等。因为牙源性颌骨囊肿往往与牙齿的病变密切相关，例如根尖周囊肿多有死髓牙、残根或残冠存在。

临床表现上，小的囊肿通常没有明显症状。随着囊肿逐渐增大，会使颌骨呈进行性、无痛性膨隆，面部会出现畸形。不同部位的囊肿会有不同的表现，如发生在上颌骨的囊肿可能会导致鼻腔堵塞、眼球移位等；发生在下颌骨的囊肿可能会引起下唇麻木。触诊时，囊肿部位的骨质可能会变薄，有乒乓球样感，当骨质完全吸收时则有波动感。

辅助检查对于诊断牙源性颌骨囊肿至关重要。X线检查是常用的方法，囊肿在X线片上多表现为圆形或椭圆形的透明阴影，边界清晰，周围常有一白色骨质反应线。不同类型的牙源性颌骨囊肿在X线片上还有各自的特点，例如根尖周囊肿可见病原牙的根尖部有圆形或椭圆形的透射区，边界清晰；含牙囊肿表现为一圆形或椭圆形透射区，边界清晰，囊腔内含有一个未萌出牙齿的牙冠。CT检查能更清晰地显示囊肿的大小、位置以及与周围组织的关系，对于判断囊肿的范围和制定治疗方案有重要意义。此外，穿刺检查也是重要的诊断手段，穿刺抽出草黄色液体，显微镜下可见胆固醇结晶，这对牙源性颌骨囊肿的诊断有重要提示作用。病理检查是确诊的金标准，通过手术切除囊肿组织进行病理切片检查，可以明确囊肿的类型。

综上所述，牙源性颌骨囊肿的诊断需要综合考虑病史、临床表现以及各项辅助检查结果，才能做出准确的判断。