慢性唾液腺炎的病因较为复杂，主要有以下几个方面。

细菌感染是常见病因之一。口腔内存在大量细菌，当唾液腺导管因结石、狭窄等原因导致唾液排出不畅时，细菌容易逆行进入唾液腺，引发感染。例如金黄色葡萄球菌、链球菌等，它们在腺体内大量繁殖，破坏腺组织，引起炎症反应。反复的细菌感染会使炎症持续存在，逐渐发展为慢性唾液腺炎。

唾液腺导管系统阻塞也是重要因素。导管结石是常见的阻塞原因，结石可来源于唾液中的钙盐沉积等。此外，导管狭窄、异物等也能造成阻塞。当导管阻塞后，唾液排出受阻，腺泡内压力升高，腺泡细胞逐渐萎缩，腺组织发生变性、纤维化，进而引发慢性炎症。而且，阻塞导致唾液引流不畅，有利于细菌滋生，进一步加重炎症。

自身免疫因素在慢性唾液腺炎的发生中也起到一定作用。某些自身免疫性疾病，如舍格伦综合征，患者体内免疫系统会错误地攻击唾液腺组织，导致腺泡和导管上皮细胞受损，唾液分泌减少，容易继发感染，形成慢性炎症。这种免疫介导的损伤通常是长期的、渐进性的。

此外，口腔卫生不良、长期吸烟、放射治疗等因素也可能与慢性唾液腺炎的发生有关。口腔卫生差会使口腔内细菌数量增多，增加感染风险；吸烟会影响唾液的分泌和成分，降低唾液的抗菌能力；放射治疗可能损伤唾液腺组织，导致唾液腺功能障碍，从而引发慢性炎症。总之，慢性唾液腺炎往往是多种因素共同作用的结果。