由于没有明确指出具体是哪两菌属，以下以常见的葡萄球菌属和链球菌属为例，介绍它们在形态特征上的区别。

葡萄球菌属细菌在显微镜下通常呈球形，直径约为0.5 - 1.5μm。它们排列成葡萄串状，这是因为在繁殖过程中，细菌细胞分裂后不完全分离而聚集在一起形成的特殊排列方式。葡萄球菌无鞭毛，不能运动，也不形成芽孢。一般情况下，葡萄球菌也没有明显的荚膜，但在少数特殊菌株中可能会有荚膜存在。

链球菌属细菌同样为球形或椭圆形，直径比葡萄球菌略小，约为0.6 - 1.0μm。其典型的排列特征是呈链状排列，这是由于细菌在一个平面上分裂，分裂后的子代细胞相互连接形成链状。链球菌也无芽孢，多数无鞭毛，不能运动。不过，部分链球菌在宿主体内或含血清的培养基中可形成较厚的荚膜，荚膜成分主要为透明质酸，具有抗吞噬作用，与细菌的致病性相关。

此外，通过革兰氏染色法，葡萄球菌属和链球菌属均为革兰氏阳性菌。但在染色后的表现上，葡萄球菌的染色较为均匀，而链球菌由于其链状排列以及细胞间紧密连接的特点，在染色时可能会出现染色深浅不一的情况。

综上所述，葡萄球菌属和链球菌属在个体形态大小、排列方式以及荚膜等方面存在明显的形态特征差异，这些特征有助于在临床检验和微生物学研究中对它们进行鉴别。