幽门螺杆菌主要生存于人体的胃部及十二指肠内。
在胃部，幽门螺杆菌偏爱胃窦部。胃窦是胃的一个重要结构区域，它的环境相对适合幽门螺杆菌生存。胃黏膜表面存在着一层黏液层，这为幽门螺杆菌提供了一定的保护屏障，使其能抵御胃酸的部分侵蚀。幽门螺杆菌凭借自身的螺旋形结构和鞭毛，能够在胃的黏液层中灵活游动，从而到达胃黏膜上皮细胞表面并定植。它会黏附在胃黏膜上皮细胞上，避免被胃的蠕动和胃酸冲刷清除。
十二指肠也是幽门螺杆菌常见的生存部位之一。当幽门螺杆菌在胃部大量繁殖后，部分细菌会随着胃内容物进入十二指肠。在十二指肠中，幽门螺杆菌可能会破坏十二指肠黏膜的正常防御机制。正常情况下，十二指肠黏膜有一定的自我保护能力，但幽门螺杆菌会引发局部的炎症反应，干扰黏膜细胞的正常代谢和修复功能，使得胃酸更容易对十二指肠黏膜造成损伤，进而可能导致十二指肠溃疡等疾病的发生。
幽门螺杆菌在胃部和十二指肠的生存与多种因素有关。它能产生尿素酶，分解尿素产生氨，从而中和周围环境的胃酸，营造一个相对适宜的微环境。同时，它还能分泌多种毒素和有毒性作用的酶，这些物质会对胃和十二指肠的黏膜细胞造成直接损害，引发一系列病理变化，如炎症、溃疡等，严重影响胃肠道的正常功能和人体健康。
