口腔黏膜上皮根据部位和功能的不同，可分为不同的类型，其中复层鳞状上皮是口腔黏膜上皮的主要类型，一般可分为四层，在角化的黏膜上皮中还会多一层，下面来详细介绍。

在非角化的口腔黏膜上皮中，从基底到表面依次为基底层、棘层、中间层和表层。基底层位于上皮的最底层，是一层立方形或矮柱状细胞，细胞具有活跃的分裂能力，可不断补充表层脱落的细胞，对上皮的更新和修复起着重要作用。棘层位于基底层上方，细胞体积较大，呈多边形，细胞间桥明显，细胞间桥实际上是细胞间的连接结构，对维持上皮的完整性有重要意义。中间层细胞的形态介于棘层和表层细胞之间，细胞逐渐变扁平。表层细胞呈扁平状，细胞器逐渐消失，细胞逐渐凋亡并脱落。

而在角化的口腔黏膜上皮中，除了上述四层外，还有角化层。角化层位于上皮的最表面，由多层已经完全角化的扁平细胞组成，这些细胞内充满了角蛋白，具有很强的抗摩擦和保护作用。角化层可以防止外界物理、化学和生物因素对口腔黏膜的损伤。例如，在硬腭、牙龈等部位的黏膜上皮就有明显的角化层。

不同部位的口腔黏膜上皮分层可能会有所差异，这与该部位的功能需求密切相关。比如咀嚼黏膜（如硬腭、牙龈）需要承受较大的咀嚼压力，所以上皮有角化层；而被覆黏膜（如颊黏膜、唇黏膜）主要起衬覆作用，一般为非角化上皮。总之，口腔黏膜上皮的分层结构是与其功能相适应的，共同维护着口腔的正常生理功能。