由于你没有明确指出“二者”具体是什么，下面我以口腔常见的两种疾病——牙源性角化囊肿和含牙囊肿为例，来阐述它们的病理区别。

牙源性角化囊肿和含牙囊肿在病理上存在多方面的差异。从囊壁上皮特征来看，牙源性角化囊肿的囊壁上皮较薄，一般厚度一致，约5 - 8层细胞，无上皮钉突。上皮表面呈波浪状或皱褶状，表层角化多呈不全角化，有时可见正角化。而含牙囊肿的囊壁上皮较薄，约2 - 5层扁平状或矮立方状细胞组成，无角化，无上皮钉突。

在纤维囊壁方面，牙源性角化囊肿的纤维囊壁较薄，一般无炎症，但合并感染时囊壁增厚，可见大量炎症细胞浸润，有时还可见子囊或卫星囊。含牙囊肿的纤维囊壁较薄，一般无炎症，若发生继发感染，囊壁内可见大量炎症细胞浸润。

从内容物上看，牙源性角化囊肿的囊液多为黄白色角化物或油脂样物质，这与它的角化特性有关。含牙囊肿的囊液多为淡黄色清亮液体，有时也可为黏液样或血性液体。

从生物学行为来讲，牙源性角化囊肿具有较高的复发倾向，其原因可能与囊壁薄、易破碎、残留的上皮岛容易增殖有关，还可能存在卫星囊或子囊。含牙囊肿一般生长缓慢，有自限性，手术摘除后复发少见。

综上所述，牙源性角化囊肿和含牙囊肿在囊壁上皮、纤维囊壁、内容物以及生物学行为等病理方面存在明显的区别，这些区别对于疾病的诊断和治疗具有重要的指导意义。