当医师在临床工作中发现药品不良反应时，应当采取以下几个步骤进行妥善处理：
1. 首先确认患者出现的症状是否与所使用的药物有关。这需要结合患者的病史、用药情况以及症状发生的时间等因素综合判断。
2. 一旦确定或高度怀疑是药物引起的不良反应，应立即停止使用可疑药物，并对患者进行必要的支持治疗和监测，以防止病情恶化。
3. 记录详细的病例资料，包括但不限于：患者基本信息、使用的药品名称及剂量、出现的不良反应表现及其持续时间等信息。这些资料对于后续处理非常重要。
4. 及时向医院药剂科或相关管理部门报告该起药物不良事件，并填写《药物不良反应/事件报告表》。必要时还需上报给国家药品监督管理部门或者相应的区域机构。
5. 对于严重或罕见的药物不良反应，医师有责任参与或协助开展进一步的研究调查工作，以了解其发生机制、影响因素及预防措施等信息。
6. 在确保患者安全的前提下，根据临床指南和专家意见调整治疗方案。同时向患者解释情况并提供心理支持，帮助他们理解当前状况以及接下来的治疗计划。
7. 加强对患者的随访观察，密切关注其恢复情况，并记录后续的变化和发展趋势。

通过上述措施，可以有效地应对药品不良反应问题，保障患者的生命健康权益。