抗生素在治疗口腔感染性疾病时，能够有效地抑制或杀灭病原微生物。但是，它们对口腔微生态环境的影响也是显著的，主要表现在以下几个方面：
1. 抗生素可以导致正常菌群失调。口腔内存在大量的有益细菌，这些细菌与人体形成共生关系，维持着口腔内的生态平衡。当使用抗生素时，不仅会杀死致病菌，也会误伤一些有益菌，使得口腔微生态失去原有的平衡状态。
2. 引发二重感染或条件性感染。由于正常微生物群被破坏后，某些原本处于劣势地位的微生物（如真菌）可能因此获得生长机会，导致新的感染问题出现。
3. 促进耐药菌株产生。长期或者不合理地使用抗生素会使敏感细菌逐渐减少，而那些具有天然抗性的菌株则会相对增多，并通过基因交换等方式进一步增强其对抗生素的抵抗能力。
4. 影响口腔局部免疫功能。正常微生物群对于刺激和维持机体特异性及非特异性的局部免疫力有重要作用，当这些微生物受到抗生素影响时，可能会减弱人体对其他潜在致病因素的防御力。
因此，在临床应用中应严格掌握适应症，合理选择药物种类、剂量以及疗程，尽量减少对抗生素的依赖性，同时注意观察患者用药后的反应情况，并采取相应措施预防和处理可能出现的问题。
