在口腔组织病理学中，区分良性与恶性的口腔黏膜色素痣主要依赖于临床表现、组织病理学特征和一些辅助检查。以下是几个关键点帮助鉴别：
1. 临床观察：良性的色素痣通常边界清晰，颜色均匀，生长缓慢或多年无明显变化。恶性色素痣（如黑色素瘤）可能呈现不规则的边缘，颜色多样（从棕色到黑色），大小增长迅速，表面可能出现溃疡、出血等。
2. 组织病理学检查：通过活检取得病变组织进行显微镜下观察是确诊的重要手段。
   - 良性色素痣细胞形态较为一致，排列有序，主要位于上皮层内。基底层的黑色素细胞数量增多但分布均匀，无明显异型性和核分裂象。
   - 恶性色素痣则表现出细胞异型性（大小不一、形状异常）、核仁显著、核分裂活跃等特征。此外，恶性病变还可能侵犯到真皮层或更深层组织，并可见到淋巴管内瘤栓形成。

3. 辅助检查：对于疑似恶变的病例，可以进行免疫组化检测以进一步确认诊断。例如，S-100蛋白、HMB45和Melan-A等标记物在恶性黑色素细胞中表达较高，有助于与其他类型的肿瘤相区分。

总之，在临床工作中，医生需要结合患者的病史、体格检查结果及组织病理学特征综合判断，并根据具体情况选择合适的治疗方案。如果遇到难以确定性质的色素痣，建议转诊至专科医院进行详细评估。