牙骨质龋和牙釉质龋是两种发生在牙齿不同部位的龋病，它们在发病机制、临床表现及治疗方式上都有所区别。
1. 发生位置与结构差异 牙釉质龋主要发生在牙齿表面的釉质层，这是牙齿最外层的一部分，也是人体中最硬的组织。而牙骨质龋则发生在根部的牙骨质上，牙骨质位于牙本质之下，覆盖于牙根表面，硬度低于牙釉质。
2. 致病因素 牙釉质龋主要是由于口腔内的细菌代谢产生的酸性物质侵蚀牙齿表面引起，通常与不良饮食习惯、口腔卫生状况不佳有关。牙骨质龋除了上述原因外，还可能因牙龈退缩导致牙根暴露而更容易受到外界刺激的影响。
3. 临床表现 牙釉质龋早期可能没有明显症状，随着病情发展可能出现白色斑点或透明区域，进一步恶化则形成黑洞状缺损。牙骨质龋由于发生在牙根部位，初期不易被发现，当病变进展到一定程度时可能会出现敏感性增加、疼痛等症状。
4. 治疗方法 牙釉质龋的治疗通常包括药物治疗（如氟化物）、充填修复等；而牙骨质龋可能需要更加重视对牙龈健康状况的关注，采取相应的预防措施来避免进一步损害，并根据具体情况选择合适的治疗方法，例如根面平整术、药物涂抹或局部封闭剂的应用。

总之，虽然两者都是由细菌引起的牙齿破坏性疾病，但因发生部位的不同，在临床表现及治疗策略上存在较大差异。