牙源性囊肿和非牙源性囊肿是口腔颌面外科中常见的两种类型，它们在起源、发生机制以及临床表现上存在明显的区别。

首先，在起源方面，牙源性囊肿主要与牙齿的发育过程有关。这类囊肿通常起源于牙齿形成过程中残留的上皮组织，比如成釉细胞或牙板上皮等。而非牙源性囊肿则不是由牙齿相关组织发展而来，它们可能来源于其他类型的胚胎残留组织、异位组织或者是由于炎症、创伤等因素引起的。

其次，在发生机制方面，牙源性囊肿多因牙齿萌出障碍、根尖周病等原因导致；而非牙源性囊肿的发生原因较为多样，包括但不限于鳃裂异常、皮样或表皮样囊肿等先天性因素，以及后天性的感染、外伤后血肿机化等。

再者，在临床表现上，两者也有一定差异。牙源性囊肿往往与特定的牙齿位置相关联，如根尖周囊肿常见于龋齿后的根尖区；而非牙源性囊肿可能出现在口腔颌面部多个部位，并且其形态、大小不一，有的甚至可以随着吞咽动作而移动。

最后，在治疗上，虽然两者都可能需要手术切除，但具体的治疗方法会根据囊肿的具体类型和患者的情况来确定。例如，对于一些较大的非牙源性囊肿，除了单纯摘除外，有时还需要进行更复杂的修复重建手术；而对于某些类型的牙源性囊肿，则可能结合根管治疗等手段。

总之，了解这两种囊肿的区别有助于临床医生做出准确诊断并制定合理的治疗方案。