根据我国相关法律法规，医疗机构如果在疫情防控中存在瞒报行为，将会面临严重的法律责任。具体来说，《中华人民共和国传染病防治法》明确规定了各类单位和个人的疫情报告义务，要求一旦发现甲类或按照甲类管理的乙类传染病病人、病原携带者或者疑似传染病病人时，必须立即向当地疾病预防控制机构报告，并按规定采取相应措施。
对于医疗机构而言，如果故意隐瞒不报、谎报疫情信息，不仅违反了上述法律规定，还可能构成《中华人民共和国刑法》中的“妨害传染病防治罪”。根据情节轻重不同，相关责任人可能会被追究刑事责任，包括但不限于拘役、有期徒刑等刑罚。此外，《医疗事故处理条例》也规定了对因瞒报导致患者损害的医疗机构及其工作人员给予行政处罚的可能性。
除了法律责任外，医疗机构还可能遭受社会信誉损失和经济上的处罚。例如，卫生行政部门可以对其作出警告、罚款、吊销执业许可证等行政处分；同时，在公众舆论中也会受到广泛谴责，影响其长期发展。
总之，医疗机构在疫情防控工作中应严格遵守国家法律法规，履行好自身职责，避免因违法行为而承担相应的法律责任和社会后果。
