在讨论囊肿的上皮衬里主要特征时，我们首先需要明确具体是哪一种口腔囊肿。因为不同类型的口腔囊肿其上皮衬里的特点可能有所不同。例如，牙源性角化囊肿（也称为成釉细胞纤维-牙瘤病）、根尖周囊肿、含牙囊肿等，它们的病理特征各有千秋。
1. 牙源性角化囊肿：这种囊肿的上皮衬里较为特殊，主要由复层鳞状上皮构成，但其显著特点是具有不完全角化的特点。在显微镜下观察时，可以看到表层细胞呈现扁平、核固缩、胞浆嗜酸性的特征，与正常的口腔黏膜上皮有明显区别。
2. 根尖周囊肿：这是一种常见的牙源性炎症性囊肿，其上皮衬里主要由非角化复层鳞状上皮组成。这种上皮细胞排列紧密，核染色较深，但没有明显的角质层形成。此外，在根尖周囊肿中还可以观察到不同程度的炎症反应和肉芽组织。
3. 含牙囊肿：含牙囊肿是一种与牙齿发育密切相关的良性病变，其上皮衬里同样由非角化复层鳞状上皮构成。值得注意的是，这种囊肿内部常含有未萌出或异位的牙齿，因此在病理切片中可以看到完整的牙体结构。

综上所述，不同类型的口腔囊肿其上皮衬里的主要特征存在差异，了解这些特点对于临床诊断和治疗具有重要意义。在实际工作中，医生需要结合患者的病史、临床表现以及影像学检查结果等信息综合判断，并通过组织病理学检查最终确定囊肿类型及其上皮衬里特性。