由于你没有明确指出“两者”具体是什么，下面我以口腔常见的两种疾病——牙源性角化囊肿和含牙囊肿为例，来介绍它们病理表现的差异。

牙源性角化囊肿的病理表现有其独特之处。在肉眼观察上，它通常是单房或多房性，囊壁较薄，囊腔内含有黄白色发亮的角化物或干酪样物质。镜下可见，衬里上皮为较薄的复层扁平上皮，一般无上皮钉突，上皮表面呈波浪状或皱褶状，表层多为不全角化，呈波纹状。棘细胞层较薄，细胞间桥不明显。基底细胞层界限清楚，呈栅栏状排列，细胞核远离基底膜。纤维囊壁较薄，一般无炎症，但有时可见微小的子囊或上皮岛。

而含牙囊肿的病理表现与牙源性角化囊肿有明显不同。肉眼观，囊肿内含牙，多为恒牙，囊壁附着于牙颈部。镜下，衬里上皮为复层扁平上皮，一般较薄，由2 - 5层扁平细胞或矮立方细胞组成，无角化，无上皮钉突。上皮与结缔组织界面平坦。纤维囊壁较薄，无明显炎症，有时可见胆固醇结晶裂隙和多核巨细胞。当囊肿继发感染时，上皮可发生增生，纤维囊壁内有大量炎症细胞浸润。

综上所述，牙源性角化囊肿和含牙囊肿在衬里上皮的角化情况、细胞形态、基底细胞排列以及纤维囊壁的特征等方面都存在明显的病理表现差异。这些差异对于准确诊断疾病、制定治疗方案以及判断预后都具有重要意义。