由于不清楚“两者”具体所指是什么，下面以口腔常见的两种病变——牙源性角化囊肿和含牙囊肿为例，来阐述它们镜下表现的区别。

牙源性角化囊肿镜下表现具有独特特征。其衬里上皮为较薄的复层扁平上皮，一般厚度较一致，约5 - 8层细胞，无上皮钉突。上皮表面常呈波浪状或皱褶状，表层角化多呈不全角化。棘细胞层较薄，细胞间桥不明显。基底细胞层界限清楚，由柱状或立方状细胞组成，胞核着色深且远离基底膜，呈栅栏状排列。纤维囊壁较薄，一般无炎症，但合并感染时囊壁增厚，可见炎细胞浸润。有时纤维囊壁内可见微小子囊和上皮岛。

含牙囊肿镜下表现则不同。其衬里上皮是复层扁平上皮，较薄，由2 - 5层扁平或矮立方状细胞组成，无角化，无上皮钉突。在囊肿成熟时，衬里上皮可变得更薄，仅由1 - 2层细胞构成。上皮与牙冠之间常呈一连续的附着关系，附着于釉质牙骨质界处。纤维囊壁较薄，含丰富的胶原纤维，有时可见牙源性上皮岛或微小囊肿，但一般较牙源性角化囊肿少见。含牙囊肿一般无明显炎症，但当发生感染时，囊壁内可见大量炎细胞浸润，上皮可出现增生，钉突伸长。

综上所述，牙源性角化囊肿和含牙囊肿在衬里上皮的厚度、角化情况、细胞形态以及纤维囊壁的特征等方面都存在明显的镜下表现差异，这些差异有助于病理医生在诊断时进行准确鉴别。