治疗肺血栓栓塞症（Pulmonary Thromboembolism, PTE）的常用药物主要包括抗凝药物、溶栓药物和止痛药等。具体选择哪种药物，需要根据患者的具体情况如病情严重程度、是否有出血风险等因素来决定。
1. 抗凝药物：这是治疗肺血栓栓塞症的基础用药，主要用于防止已形成的血栓进一步扩大以及新的血栓形成。常用的抗凝药物包括肝素（普通肝素和低分子量肝素）、华法林等新型口服抗凝药如达比加群酯、利伐沙班、阿哌沙班等。
2. 溶栓药物：对于部分病情较重，存在大面积肺动脉阻塞的患者，在条件允许的情况下可以考虑使用溶栓治疗。常用的溶栓药物有尿激酶、链激酶和重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）等。但需要注意的是，溶栓治疗具有一定的出血风险，因此在选择时需谨慎评估。
3. 止痛药：对于伴有胸痛等症状的患者，可适当给予非甾体类抗炎药物或阿片类药物缓解症状。
此外，在某些特殊情况下，如严重右心功能不全、持续低氧血症等，则可能需要采取介入治疗或者外科手术等方式进行处理。在整个治疗过程中，医生应密切监测患者的各项生理指标变化，并根据实际情况调整治疗方案。
