器官功能衰竭之所以被认为是不可逆的主要原因在于，当一个器官受到严重损害时，其细胞结构和功能可能会遭受永久性破坏。这种破坏可以是由于缺血、毒素暴露、感染或其他疾病过程导致的广泛性损伤。一旦这些损伤超出了机体自我修复的能力范围，就可能导致该器官无法恢复正常的功能。

具体来说：
1. 细胞死亡：在严重的器官损害中，细胞可能发生坏死或凋亡（程序性死亡）。当大量细胞丧失时，即使剩余健康组织尝试补偿，也可能不足以恢复器官的正常功能。
2. 纤维化和瘢痕形成：长期损伤后，受损区域可能会出现纤维化反应，即由结缔组织替代了正常的实质细胞。这种变化会导致器官结构改变，并且影响其弹性或收缩能力等关键特性，从而限制了其功能恢复的可能性。
3. 血流供应减少：某些类型的器官衰竭（如心力衰竭）可能导致其他器官的血流灌注不足，进而引起多器官系统的连锁反应性损伤。一旦进入这种状态，即使原发疾病得到控制，受损器官也可能难以完全复原。

因此，在临床上，对于已经发生不可逆损害的患者，治疗重点通常转向支持生命、减轻症状以及提高生活质量等方面，而非试图恢复原有器官的功能。