BCR-ABL融合基因在慢性粒细胞白血病（CML）中扮演着关键的角色。这个基因是由位于第22号染色体的BCR基因和位于第9号染色体的ABL基因通过染色体重排而形成的。这种重排通常被称为费城染色体，是CML的一个标志性特征。

BCR-ABL融合基因编码一种异常的蛋白质，即BCR-ABL蛋白。正常情况下，ABL基因编码的是一种酪氨酸激酶，它在细胞信号传导中起重要作用。然而，在CML患者中，由于BCR与ABL的融合，产生了具有持续激活状态的酪氨酸激酶活性的蛋白质。这种持续激活导致了细胞增殖失控、抑制细胞凋亡和促进白血病细胞的生存及发展。

具体来说，BCR-ABL蛋白通过激活多种下游信号通路（如PI3K/AKT、MAPK等）来影响细胞的行为。这些信号通路与细胞生长、分裂、存活和迁移密切相关。因此，BCR-ABL融合基因不仅是CML发病机制中的一个关键驱动因素，也是该疾病治疗的重要靶点。

临床上，针对BCR-ABL蛋白的酪氨酸激酶抑制剂（如伊马替尼）已被证明对许多CML患者非常有效，能够显著延长生存期并提高生活质量。这些药物通过特异性地结合到BCR-ABL蛋白上的特定位点，阻止其激活下游信号通路，从而达到治疗效果。