新生儿筛查甲状腺功能减退症（简称“甲减”）时，主要检测的是血清中的促甲状腺激素（TSH，Thyroid-Stimulating Hormone）。这是因为TSH是垂体分泌的一种激素，它能够促进甲状腺合成和释放甲状腺素。在甲状腺功能正常的情况下，血液中TSH的水平会保持在一个相对稳定的范围内。当新生儿存在先天性甲状腺功能减退时，由于甲状腺不能产生足够的甲状腺素来满足身体的需求，机体会通过增加TSH的分泌量试图刺激甲状腺工作，从而导致血清中的TSH浓度升高。
因此，在新生儿筛查项目中，通常会在出生后2-3天采集足跟血样本进行检测。如果初筛结果显示TSH水平异常增高，则需要进一步做确诊性检查，如测定游离T4（FT4）等指标，以明确是否存在甲状腺功能减退，并及时给予治疗干预。
值得注意的是，新生儿甲减筛查是一项重要的公共卫生措施，可以早期发现并治疗该疾病，避免因未经治疗的先天性甲减导致儿童智力发育障碍等问题。
