氨基酸之间是通过肽键（也称为酰胺键）相互连接形成肽链的。肽键是由一个氨基酸分子中的氨基（-NH2）和另一个氨基酸分子中的羧基（-COOH）脱水缩合反应形成的，这个过程会释放出一分子水。具体来说，在肽键形成过程中，一个氨基酸的α-羧基与相邻氨基酸的α-氨基发生反应，生成了-NH-CO-结构，即肽单元。
肽链中各个氨基酸残基之间的这种连接方式对于蛋白质的一级结构至关重要，它不仅决定了多肽链的基本骨架，还影响着蛋白质的空间构象及其生物学功能。在生物体内，通过一系列酶的催化作用，可以实现肽键的形成与断裂，从而调控蛋白质的合成、修饰及降解等过程。
此外，值得注意的是，在实际的蛋白分子中，除了主链上的肽键外，侧链之间还可能存在着其他类型的相互作用力（如氢键、离子键、疏水作用等），这些作用共同维持着蛋白质复杂而精确的空间结构。
