肠结核的诊断需要综合临床表现、实验室检查和影像学检查等多种方法来进行。首先，从临床症状上看，患者可能会出现长期不规则发热、腹痛（尤其是右下腹部）、体重减轻、腹泻或便秘等非特异性症状。部分患者可能伴有盗汗、乏力等症状。如果患者有肺结核病史或者与活动性肺结核患者密切接触的历史，则需要高度怀疑肠结核的可能。

其次，实验室检查方面，可以进行血液常规检查，观察是否有贫血、白细胞计数异常等情况；粪便检查可寻找抗酸杆菌或做培养以检测结核分枝杆菌。此外，还可以通过血清学试验如ELISA等方法检测特异性抗体水平，但这些测试的敏感性和特异性有限。

影像学检查是诊断肠结核的重要手段之一。腹部X线平片可能显示肠管扩张、粘连等改变；钡餐造影可见到跳跃征象（即病变部位与正常肠道之间的突然过渡）、狭窄段以及瘘管形成等特征性表现；CT扫描可更清晰地显示出肠壁增厚、淋巴结肿大及周围组织受累情况。近年来，随着内镜超声技术的发展，其在诊断小肠疾病中的应用越来越广泛，对于判断病变范围和程度具有较高的价值。

最后，在上述检查基础上，必要时还需做病理活检以明确诊断。通过内镜取材或手术探查获取疑似病灶组织进行细菌学、细胞学及组织化学等多方面的分析，是确诊肠结核的金标准。

总之，肠结核的确诊需要结合患者的临床表现、实验室检查结果和影像学特征，并最终依靠病理活检来确定。