氨基酸通过特定的方式连接在一起，形成多肽链。这个过程主要是由细胞内的核糖体完成的，在蛋白质合成的过程中进行。具体来说，氨基酸之间是通过肽键（peptide bond）相连的。肽键是一种酰胺键，它是在一个氨基酸的羧基（-COOH）和另一个氨基酸的氨基（-NH2）之间形成的。

首先，当mRNA（信使核糖核酸）携带遗传信息从细胞核进入细胞质，并与核糖体结合时，蛋白质合成过程就开始了。tRNA（转运核糖核酸）分子会根据mRNA上的密码子选择特定的氨基酸并将其带到核糖体处。每个tRNA上都连接有一个特定的氨基酸。

在核糖体中，第一个被选中的氨基酸通过其羧基与第二个氨基酸的氨基发生脱水缩合反应，释放出一分子水，并形成一个肽键。这样两个氨基酸就通过这个肽键连接在一起了。随着mRNA上的密码子不断被读取，更多的tRNA将相应的氨基酸带至核糖体处，每个新来的氨基酸都会以同样的方式与链上最后一个氨基酸的羧基反应，逐渐延长多肽链。

当遇到终止密码子时，蛋白质合成过程结束，形成的多肽链从核糖体上释放出来。随后这条多肽链可能会进一步折叠成特定的空间结构，形成具有生物活性的蛋白质分子。

这就是氨基酸如何通过肽键连接形成长链的过程，也是蛋白质合成的基础机制之一。希望这个解释对你有所帮助！