呼吸链是由一系列的递氢体和递电子体按一定顺序排列所组成的连续反应体系，它将代谢物脱下的成对氢原子交给氧生成水，同时有ATP生成。呼吸链电子传递顺序有两条主要途径，分别是NADH氧化呼吸链和FADH₂氧化呼吸链。

NADH氧化呼吸链的电子传递顺序为：代谢物在脱氢酶的作用下，将氢原子（2H）交给NAD⁺，使其还原为NADH H⁺。NADH H⁺在NADH - 泛醌还原酶（复合体Ⅰ）的作用下，将电子传递给FMN，FMN接受电子后被还原为FMNH₂。接着，FMNH₂又将电子传递给铁 - 硫蛋白（Fe - S），铁 - 硫蛋白再将电子传递给泛醌（Q），泛醌接受电子和质子被还原为还原型泛醌（QH₂）。还原型泛醌将电子传递给细胞色素bc₁复合体（复合体Ⅲ），在复合体Ⅲ中，电子先传递给细胞色素b，再经铁 - 硫蛋白传递给细胞色素c₁，最后传递给细胞色素c。细胞色素c将电子传递给细胞色素氧化酶（复合体Ⅳ），在复合体Ⅳ中，电子依次经过细胞色素a和细胞色素a₃，最终将电子传递给氧，氧接受电子后与质子结合生成水。

FADH₂氧化呼吸链的电子传递顺序是：代谢物脱下的氢由FAD接受，生成FADH₂。FADH₂将电子传递给琥珀酸 - 泛醌还原酶（复合体Ⅱ）中的铁 - 硫蛋白，然后电子传递给泛醌，后续的电子传递过程与NADH氧化呼吸链从泛醌开始的过程相同，即泛醌将电子依次传递给复合体Ⅲ、细胞色素c、复合体Ⅳ，最终将电子传递给氧生成水。

呼吸链中电子传递的顺序是高度有序和严格的，这种顺序保证了电子能够沿着能量逐步降低的方向传递，同时释放出的能量用于驱动ATP的合成，为生物体的生命活动提供能量。