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对于人体的生理活动，中医学也是用阴阳学说加以说明的，认为人的正常生命活动，是机体内部以及机体与环境之间阴阳协调平衡的结果，所谓“阴平阳秘，精神乃治 ”。如以物质与功能而言，物质属阴，功能属阳。人体的生理功能是以体内物质为基础的，没有物质的运动，就无以产生功能活动，而功能活动一方面消耗着能量与物质，另一方面其结果促进着物质的新陈代谢，有助于物质的摄入和能量的贮存。物质与功能的关系，也就是阴阳相互制约、资生、不断消长转化的过程。
再如人体的睡眠活动，是属阳的兴奋与属阴的抑制两种功能对立统一运动的结果。人在白昼，体内属阳的兴奋制约了属阴的抑制而占主导地位，所以处于醒寤的兴奋状态；进入黑夜，体内属阴的抑制制约了属阳的兴奋而占主导地位，所以人就进入睡眠状态。显然人的睡眠活动就是机体内部阴阳对立统一运动的结果。就人体物质之间的关系而言，气和血分阴阳，属阳的气具有生血、行血和摄血的功能，而属阴的血具有载气、寓（藏）气、养气的作用。可见，气血之间又体现着阴阳关系的多个层面。此外，如营卫关系、气与精或津液关系、脏腑关系、经络关系，也是如此。因此说“生之本，本于阴阳”。
