西医治疗再生障碍性贫血的主要方法包括药物治疗和造血干细胞移植。对于轻度到中度的患者，通常首选药物治疗，常用的药物有免疫抑制剂如环孢素A、抗胸腺细胞球蛋白（ATG）等，这些药物可以抑制异常的免疫反应，减少对骨髓造血功能的损害。此外，雄激素类药物也可以促进红细胞生成。对于重度或极重度再生障碍性贫血患者，如果条件允许，造血干细胞移植是更为有效的治疗方法，尤其是年轻患者和有合适供者的患者，通过移植健康的造血干细胞可以重建患者的造血系统，达到治愈的目的。
在治疗过程中，医生还会根据患者的具体情况给予支持治疗，比如输注红细胞或血小板以缓解贫血症状、预防感染等。整个治疗方案需要个体化制定，并且要定期评估疗效和调整治疗计划。
