中医在治疗流行性乙型脑炎（简称“乙脑”）时，主要强调以下几个原则：
1. 清热解毒：由于乙脑是由病毒引起的急性传染病，初期常表现为高热、头痛等症状。因此，在治疗上首先需要清热解毒，以减轻炎症反应和病毒对机体的侵害。
2. 活血化瘀：随着疾病的进展，患者可能出现意识障碍等神经系统损害表现。此时应采用活血化瘀的方法来改善微循环，促进受损组织修复。
3. 益气养阴：长期发热或重症情况下，容易导致人体正气虚弱、津液亏损。因此，在治疗过程中还需注重益气养阴，增强机体抵抗力。
4. 调和阴阳：根据中医理论，疾病的发生发展与体内阴阳失衡有关。故在乙脑的治疗中也需注意调和阴阳，使身体恢复平衡状态。
5. 辨证施治：每个患者的体质、病情都有所不同，因此在具体用药时要结合个人实际情况进行辨证论治，选择合适的方药组合。
以上就是中医治疗乙脑时所强调的一些基本原则。实际应用中还需根据患者的具体情况灵活调整方案，并与现代医学相结合，以达到最佳疗效。
