慢性肾炎的主要病理变化涉及肾脏结构的广泛损伤，这种损伤是逐渐发展的，并且常常导致肾功能减退。具体来说，慢性肾炎的病理特征包括以下几个方面：
1. 肾小球的变化：这是慢性肾炎最显著的病变部位。在显微镜下可以看到肾小球出现不同程度的硬化、萎缩或扩张等改变。部分肾小球可能因为炎症反应而发生纤维化，导致功能丧失。此外，还可能出现新月体形成，即肾小囊壁层上皮细胞增生形成的半月形结构。
2. 肾间质的变化：慢性肾炎患者可能会出现肾间质水肿、淋巴细胞浸润及纤维组织增生的现象。这些变化反映了免疫反应和炎症过程对肾脏非泌尿部分的影响。
3. 血管系统的变化：随着疾病进展，肾内小动脉壁可发生玻璃样变性或硬化，影响血流供应；大中型血管也可能受到累及，表现为粥样硬化等改变。
4. 肾小管的损害：慢性肾炎时，肾小管上皮细胞可能出现萎缩、坏死或者再生现象。由于肾小球滤过率降低，导致代谢产物在体内蓄积，进一步加重了对肾小管的毒性作用。
5. 全身性改变：长期存在的慢性炎症状态可引起高血压、贫血等全身症状，这些因素反过来又会加速肾脏损伤的发展。

总之，慢性肾炎的病理变化是一个复杂的多系统受损过程，其最终结果是导致肾单位数量减少和功能障碍，进而发展为慢性肾衰竭。因此，在临床诊断与治疗中需要综合考虑患者的个体差异及病情特点，采取针对性措施以延缓疾病进程、改善患者生活质量。