在传染病疫情期间，医疗机构采取的首要控制措施通常包括以下几个方面：
首先，对疑似或确诊病例进行及时有效的隔离。这是防止疫情扩散的关键步骤之一。通过将患者与健康人群隔离开来，可以有效减少病毒传播的风险。
其次，加强医院内部的感染防控工作。这涉及到严格执行手卫生、佩戴个人防护装备（如口罩、手套等）、定期消毒清洁环境表面以及合理安排医护人员的工作流程等方面，以降低院内交叉感染的可能性。
此外，医疗机构还需要建立健全疫情报告制度，确保能够快速准确地收集和上报相关数据信息给上级部门及公共卫生机构。这对于及时掌握疫情动态、制定应对策略具有重要意义。
同时，开展健康教育也是必不可少的一环。通过向患者及其家属宣传正确的防护知识和措施，提高他们的自我保护意识与能力，从而有助于共同遏制疾病的传播。
最后，对于需要外出就诊的非感染性疾病患者，医院应尽量提供远程医疗服务或者设立专门通道，减少其在院区内停留时间及与其他人员接触的机会，降低被感染的风险。
综上所述，在传染病疫情期间，医疗机构采取上述一系列综合性的防控措施是非常必要的。
