内伤头痛主穴的选取需要根据中医经络理论和头痛的发病机制来确定。其主穴包括百会、头维、风池、足三里、太冲。

百会穴位于头部，当前发际正中直上5寸，或两耳尖连线的中点处。它是督脉上的重要穴位，督脉入络脑，百会能调节头部气血，起到醒脑开窍、升阳固脱的作用。对于内伤头痛，刺激百会可改善头部气血运行，缓解头痛症状。

头维穴在头侧部，当额角发际上0.5寸，头正中线旁4.5寸。它是足阳明胃经与足少阳胆经的交会穴，阳明经多气多血，刺激头维能疏通局部气血，调和经气，对头侧部的疼痛有很好的治疗效果。

风池穴在项部，当枕骨之下，与风府相平，胸锁乳突肌与斜方肌上端之间的凹陷处。风池为足少阳胆经穴位，且是祛风要穴，内通脑窍。内伤头痛多与肝风内动、风邪上扰等有关，针刺风池可祛风通络、清利头目，有效缓解头痛。

足三里位于小腿外侧，犊鼻下3寸，犊鼻与解溪连线上。它是足阳明胃经的合穴，具有调理脾胃、补中益气、通经活络等功效。内伤头痛常与脾胃虚弱、气血不足有关，通过刺激足三里可增强脾胃功能，使气血生化有源，濡养头部，从而减轻头痛。

太冲穴在足背，第1、2跖骨间，跖骨底结合部前方凹陷中，或触及动脉搏动。太冲是足厥阴肝经的原穴，肝主疏泄，内伤头痛尤其是与肝郁气滞、肝阳上亢相关的头痛，刺激太冲能疏肝理气、平肝潜阳，使肝气条达，阴阳平衡，缓解头痛症状。

这些主穴相互配合，从不同方面调节人体气血、脏腑功能，以达到治疗内伤头痛的目的。在临床应用时，还需根据患者具体的辨证情况进行配穴，以提高治疗效果。