主管药师在疾病发病初期应当采取一系列积极有效的干预措施，以确保患者能够获得及时、安全和有效的治疗。这些措施主要包括：
1. 参与临床会诊：当有新发病例时，主动参与临床医生的讨论，根据自己的药学知识提供合理的用药建议。
2. 评估药物治疗方案：对医生开具的处方进行审核，检查是否存在不适当或潜在危险的药物组合，确保所选药物适合患者的具体情况。
3. 监测不良反应：密切观察患者的用药过程，一旦发现任何可能由药物引起的副作用或者过敏反应，应立即向临床医师报告，并提出相应的处理建议。
4. 提供健康教育：向患者及其家属普及有关疾病的知识以及正确的服药方法，帮助他们理解治疗计划的重要性，提高依从性。
5. 促进合理用药：结合最新的研究进展和指南推荐，指导医生选择最适合患者的药物种类、剂量及给药途径等，避免滥用抗生素等问题的发生。
6. 协助管理慢性病患者：对于需要长期服药的慢性疾病患者，定期随访其病情变化，及时调整药物使用方案，减少并发症的风险。

通过上述措施，主管药师可以在疾病的早期阶段发挥重要作用，不仅有助于改善患者的预后，还能提高医疗服务质量。