在处理中药士审批决定的争议时，可以采取以下几个步骤来确保问题得到妥善解决：
1. 了解具体争议点：首先需要明确争议的具体内容是什么，比如是关于资格认证、考试成绩、还是其他方面的审批事项。这一步骤对于后续解决问题至关重要。
2. 查阅相关法律法规和政策文件：根据争议的内容，查阅国家或地方对中药士执业资格管理的相关法律、法规及政策规定，确保自己的权益不受侵害，并且处理问题时有据可依。
3. 提交书面申诉材料：如果认为审批决定存在不公正的情况，可以向负责审批的机构提交书面申诉申请。在申诉书中详细说明争议的事实依据和理由，并附上相关证明材料。
4. 申请复审或听证会：部分情况下，申请人有权要求进行复审或者参加听证会，以便更全面地表达自己的意见并提供证据支持。
5. 寻求法律援助：当通过正常渠道无法解决问题时，可以考虑寻求专业律师的帮助。律师可以帮助分析案件情况，并指导如何依法维护自身权益。
6. 保持沟通与合作态度：在整个过程中，应保持积极主动的态度，及时与相关部门进行有效沟通。同时也要尊重对方的工作流程和时限要求，避免采取过激行为影响问题的解决进度。

通过以上步骤，通常能够有效地处理中药士审批决定中的争议问题。如果最终仍然无法达成一致意见，则可能需要借助第三方机构或法院来进行裁决。