主管药师在制定治疗原则时，需要综合考量多个方面的因素以确保治疗方案的安全性、有效性和合理性。这些因素主要包括：
1. 患者的具体病情：包括疾病的类型、程度以及患者的身体状况等。了解患者的详细病史对于选择合适的药物及其剂量至关重要。
2. 药物的特性：考虑所选药物的作用机制、药代动力学特点（如吸收、分布、代谢和排泄）、可能产生的副作用及禁忌症等因素，确保用药的安全性和有效性。
3. 患者个体差异：不同患者对同一药物可能存在不同的反应。因此，在制定治疗原则时需要考虑到年龄、性别、遗传背景等个体化因素的影响。
4. 药物相互作用：如果患者正在使用多种药物，则需特别注意这些药物之间是否存在潜在的相互作用，避免不良后果的发生。
5. 经济成本与可获得性：选择经济实惠且容易获取的治疗方案可以提高患者的依从性和满意度。同时也要考虑到医保政策等因素对患者实际支付能力的影响。
6. 法律法规及伦理标准：遵守相关法律法规和医疗行业内的伦理规范，确保所有决策都在合法合规的前提下进行。
7. 最新研究进展：关注最新的科学研究成果和技术发展动态，及时更新自己的知识体系，并将这些新的发现合理应用于临床实践中去。

通过全面考虑上述各方面因素，主管药师能够制定出更加科学合理的治疗原则，从而更好地服务于患者。