主管中药师在日常工作中需要确保药品的安全性和有效性，因此掌握正确的消毒方法是非常重要的。一般来说，主管中药师应该了解并能够应用以下几种主要的消毒方法：
1. 物理消毒法：包括热力消毒（如干热、湿热灭菌）、紫外线消毒、过滤除菌等。这些方法适用于不同的场合和物品，比如药液、玻璃器皿、空气等。
2. 化学消毒法：通过使用化学药品来杀灭或抑制微生物的生长繁殖。常用的化学消毒剂有酒精、碘伏、过氧乙酸、甲醛溶液等。主管中药师需要熟悉各种化学消毒剂的作用机制、适用范围及安全操作规程。
3. 辐射消毒法：利用放射性元素产生的γ射线或其他类型的辐射进行灭菌处理，适用于一些不耐高温的药品和医疗器械。
4. 微波消毒法：利用微波能量加热物体内部水分达到杀菌效果。这种方法速度快，但需要注意控制好温度以免损坏物品。
5. 环境清洁与消毒：除了直接对药物及其包装材料进行消毒外，还需要关注工作环境的卫生状况，定期开展地面、墙面以及设备表面的清洁和消毒工作。

主管中药师在选择具体的消毒方法时，应根据实际情况考虑待处理物性质、微生物种类及数量等因素，并严格按照相关标准操作规程执行。同时也要注意个人防护措施，保障自身安全。