根及根茎类中药鉴别的主要依据包括以下几个方面：

首先，外观特征是根及根茎类中药鉴别的基础。这涉及到药材的颜色、形状、大小、表面纹理等。例如，黄连的根茎呈黄色或淡黄色，有明显的节和须根痕；而白芷则为圆锥形，外表皮白色至灰棕色，质地硬脆。

其次，断面特征也是重要的鉴别依据之一。这包括药材横切面或纵切面的颜色、纹理、组织结构等。如当归的断面呈黄白色，可见多数淡黄色点状维管束散在；而大黄的根茎断面则有明显的星点（异常维管束）。

第三，气味特征对于某些根及根茎类中药来说是非常重要的鉴别手段。一些药材具有特殊的香气或味道，如川芎散发出清新的香草味，而细辛则有一种辛辣的味道。

第四，水试、火试等物理化学反应也是常用的鉴别方法之一。例如，将人参粉末投入热水中，水面会形成一层油状漂浮物；丹参遇水后可使水变红紫色。

最后，显微鉴定技术可以进一步确认药材的真伪优劣。通过观察药材粉末或切片在显微镜下的细胞结构、淀粉粒、石细胞等特征，能有效地区分不同种类甚至同种但质量不同的根及根茎类中药。

综上所述，根及根茎类中药的鉴别需要综合运用外观、断面、气味、物理化学反应以及显微等多种方法来进行。