在中药学中，清理非药用部位是一项非常重要的工作，它直接关系到药材的质量和药效。清理非药用部位主要依据以下几个标准：

首先，根据《中国药典》的规定。《中国药典》是国家制定的药品质量标准法定技术规范，对于每种中药材都有详细的描述，包括其来源、性状、鉴别、检查、含量测定等。其中，关于药材的加工与炮制部分会明确指出哪些是非药用部位需要去除。

其次，依据传统中医药理论。中医认为，不同的植物部位具有不同的药性和功效，因此在使用时往往只选取特定的部分入药。例如，根类药材通常要去除地上部分；果实种子类则需去除非果肉或种皮等非药用成分。

再次，考虑药物的安全性与有效性。一些非药用部位可能含有有毒物质或者会影响主要活性成分的吸收和利用，因此在制备过程中需要将其去除以确保用药安全有效。

最后，结合现代科学研究成果。随着科学技术的发展，对于某些传统认为无用但实际可能含有效成分的部分，经过科学验证后可能会被重新评估其价值，并适当调整清理标准。

总之，在进行中药材非药用部位的清理时，应综合考虑以上几个方面，既要尊重经典文献和传统经验，也要结合现代研究进展，确保药材的质量符合临床应用的要求。