在药品生产过程中，控制微生物污染是确保药品质量与安全的关键环节。为了有效防止微生物的污染，通常会采取一系列综合措施：

首先，在设计和建造生产车间时，应严格遵循GMP（良好生产规范）的要求，合理布局车间结构，设置清洁区、准清洁区及非清洁区，并通过空气过滤系统保持室内正压状态，以减少外界空气中微生物进入的风险。同时，对地面、墙面等材料的选择也需考虑其易于清洗和消毒的特性。

其次，在人员管理方面，所有进入生产区域的工作人员都必须接受严格的卫生培训，掌握正确的洗手、更衣方法，并定期进行健康检查，确保不携带病原体进入工作场所。此外，还应限制非相关人员进出生产区，以减少交叉污染的可能性。

再次，对于原材料和辅料的采购与储存环节，要严格筛选供应商，保证其提供的物料符合相关标准；在入库前还需经过微生物检测合格后方可使用，并且存放在干燥通风、温度适宜的地方，避免滋生细菌或霉菌。

最后，在生产操作过程中，应采用无菌技术或密闭系统减少暴露机会，定期对生产设备进行清洁消毒处理；对于一些关键工序如灌装封口等，则需要在层流洁净室中完成。同时，还需建立完善的质量控制系统，通过取样检测等方式监控整个生产过程中的微生物水平，确保最终产品的安全性。

综上所述，药品生产过程中控制微生物污染是一项系统工程，涉及到硬件设施、人员管理、物料控制以及工艺操作等多个方面，只有全面实施才能有效保障药品的质量安全。