肾的主要生理功能包括肾藏精、肾主水和肾主纳气三个方面。

肾藏精，是指肾具有贮存、封藏精气的生理功能。精是构成人体和维持人体生命活动的最基本物质，肾所藏的精气包括“先天之精”和“后天之精”。先天之精禀受于父母，是构成胚胎发育的原始物质；后天之精来源于水谷精微，由脾胃化生并灌输给五脏六腑。两者相互依存、相互为用，先天之精需要后天之精的不断滋养才能充分发挥其生理效应，后天之精又依赖先天之精的活力资助才能不断化生。肾藏精的功能失常，就会出现生长发育迟缓、生殖功能障碍以及早衰等病症。

肾主水，是指肾具有主持和调节人体水液代谢的功能。肾对水液代谢的调节作用，主要是通过肾的气化功能来实现的。肾的气化作用贯穿于水液代谢的全过程，它将肺、脾、三焦等脏腑参与代谢后产生的浊液，经过气化作用，使其中清者重新吸收利用，浊者化为尿液，下输膀胱而排出体外。若肾的气化功能失常，就会导致水液代谢障碍，出现水肿、小便不利等症状。

肾主纳气，是指肾有摄纳肺所吸入的清气，防止呼吸表浅的作用，从而保证体内外气体的正常交换。人体的呼吸功能，虽为肺所主，但必须依赖肾的纳气作用，才能保持呼吸的深度。只有肾的纳气功能正常，才能使肺的呼吸均匀，气道通畅。如果肾的纳气功能减退，摄纳无权，就会出现呼吸表浅、动辄气喘等肾不纳气的症状。

综上所述，肾的藏精、主水和主纳气功能，对于维持人体的生长发育、生殖、水液代谢和呼吸功能等方面起着至关重要的作用，是人体生命活动的根本。