黄连根茎的主成分主要包括生物碱类以及其他一些成分。

生物碱是黄连根茎最为重要的成分。其中，小檗碱是含量最高且最为关键的生物碱之一。小檗碱具有广泛的药理活性，它具有显著的抗菌作用，对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌都有抑制效果，比如金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等，在临床上常用于治疗肠道感染、菌痢等疾病。同时，小檗碱还具有抗炎、调节血糖、调节血脂等作用。它可以抑制炎症介质的释放，减轻炎症反应；通过影响胰岛素的分泌和作用，对血糖进行一定的调节；并且能够降低血液中胆固醇和甘油三酯的水平。

黄连根茎中还含有黄连碱、甲基黄连碱、巴马汀、药根碱等生物碱。黄连碱也有抗菌、抗炎等作用，与小檗碱协同发挥药效。巴马汀在抗菌、抗病毒方面有一定功效，对一些呼吸道和消化道感染有治疗作用。药根碱则具有一定的心血管活性，能够影响心脏的功能和血管的张力。

除了生物碱类，黄连根茎中还含有一些其他成分。例如黄酮类化合物，它们具有抗氧化作用，能够清除体内自由基，保护细胞免受氧化损伤。此外，还含有多糖类物质，多糖具有免疫调节等作用，可以增强机体的免疫力，提高身体的抵抗力。挥发油也是黄连根茎中的成分之一，虽然含量相对较少，但也可能具有一定的药理活性，比如可能具有一定的镇静、镇痛等作用。总之，黄连根茎的多种成分共同作用，使其具有广泛的药用价值。