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地衣的形态分为壳状、叶状和枝状。内部构造也不相同。
①叶状地衣分为上皮层、藻胞层、髓层和下皮层。上下皮层是由横向分裂的菌丝紧密交织而成，特称为假皮层。上皮层内常含大量色素。藻细胞分布于上皮层之下，成层排列的，称为异层地衣；散乱分布的，称为同层地衣。在异层地衣中，藻胞层之下和下皮层之上为髓层，在同层地衣中则无藻胞层和髓层的区别。
②一般典型的壳状地衣多缺乏皮层或只有上皮层。
③枝状地衣内部构造成辐射状，具有致密的外皮层、薄的藻胞层及中轴型的髓，如松萝科（Usneaceae）。
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