疟疾在临床上需要与多种发热性疾病进行鉴别，主要因为它们的症状有相似之处。常见的需要鉴别的疾病包括：
1. 流行性感冒（流感）：流感和疟疾都可引起高热、寒战等症状，但流感通常伴有明显的呼吸道症状如咳嗽、咽痛等。
2. 败血症：败血症是一种全身性的感染反应，可以导致发热、白细胞计数异常变化。与疟疾不同的是，败血症患者可能有原发感染灶的体征和实验室检查结果支持。
3. 登革热：登革热也是一种由蚊子传播的病毒性疾病，常见于热带地区。其临床表现包括突发高烧、剧烈头痛、眼后痛、关节肌肉疼痛等，部分病例可出现皮疹。
4. 细菌性痢疾：细菌性痢疾是由志贺氏杆菌引起的一种肠道传染病，主要表现为腹泻（水样或血便）、腹痛等症状，但也可以伴随发热。通过粪便培养可以确诊。
5. 钩端螺旋体病：该疾病由钩端螺旋体感染所致，临床特点为发热、肌肉疼痛尤其是小腿肌群、眼结膜充血等，部分患者可出现黄疸。
6. 斑疹伤寒：斑疹伤寒是由立克次氏体引起的一种急性传染病，主要通过跳蚤或虱子传播。典型症状包括突发高热、头痛、皮疹等。
7. 其他寄生虫病如阿米巴痢疾等也可能需要与疟疾相鉴别。

为了正确诊断和治疗，医生会根据患者的流行病学史（例如是否到过疟疾流行区）、临床表现以及实验室检查结果来综合判断。如果怀疑为疟疾，则需进行血液涂片镜检或快速诊断试纸检测以确认是否存在疟原虫感染。