针灸治疗神经系统疾病时，选穴的原则主要基于中医理论中的经络学说和脏腑辨证。首先，需要明确神经系统的病变部位及其功能障碍的特点，然后结合患者的具体症状进行个体化的穴位选择。以下是几个基本的选穴原则：
1. 局部取穴：根据病变部位选取附近的穴位，如治疗面瘫可以选择地仓、颊车等面部穴位；治疗颈椎病引起的上肢麻木可以选取颈部和肩部的相关穴位。
2. 远端取穴：即在远离病变区域的经络上选穴。例如，治疗下肢运动障碍时可选用足三里（位于小腿）、太溪（位于脚踝）等穴位来调节下肢的功能。
3. 随症配穴：根据患者的具体症状灵活选择穴位。如伴有头痛者加用太阳、百会；若情绪抑郁则考虑加入神门、内关以调心安神。
4. 经络辨证取穴：依据中医理论中十二正经及奇经八脉的走向和功能，结合患者的临床表现进行选穴。比如治疗因肝风内动所致的手足抽搐，可选用太冲（属肝经）、曲池（属大肠经）等穴位。
5. 脏腑辨证取穴：针对神经系统疾病可能涉及到的不同脏腑机能异常，选取相应背俞穴或募穴。如脑血管病后遗症患者常伴有脾胃虚弱表现，则可用脾俞、胃俞来调理脾胃功能。
6. 现代研究支持的选穴：近年来，随着针灸学与神经科学交叉领域的深入研究，发现某些特定穴位对于特定神经系统疾病具有良好的疗效。例如，电针刺激“三阴交”可以改善帕金森病患者的运动功能障碍等。

总之，在实际临床应用中，医生需要综合考虑上述原则，并结合患者的具体病情变化灵活运用，才能达到最佳的治疗效果。