小柴胡汤出自《伤寒论》，其组成为柴胡、黄芩、人参、半夏、甘草、生姜、大枣。关于小柴胡汤的君药，目前主要有两种观点，一种认为君药是柴胡，另一种认为君药是柴胡与黄芩相须为用。下面分别进行阐述。

多数医家认为柴胡是小柴胡汤的君药。从功效来看，柴胡具有和解少阳、疏肝解郁、升阳举陷等功效。在小柴胡汤所主治的伤寒少阳证中，邪入少阳，正邪分争于半表半里之间，导致枢机不利。柴胡苦平，能入肝胆经，可透泄少阳之邪从外而解，又能疏泄气机之郁滞，使少阳之邪得以疏散，从而恢复少阳枢机的正常功能。从方剂的配伍意义来讲，柴胡在方中用量相对较大，其主导作用明显。小柴胡汤的主要目的是和解少阳，柴胡的这一作用契合了方剂的主要功效方向，它能够引导整个方剂的药力作用于少阳经，针对主证发挥关键治疗作用。

也有部分观点认为柴胡与黄芩相须为用共同作为君药。黄芩苦寒，能清泄少阳之里热。在伤寒少阳证中，正邪交争，不仅有邪犯少阳之表的表现，也会有里热渐生的情况。柴胡透散半表之邪，黄芩清泄半里之热，二者一散一清，相辅相成，能够全面针对少阳病半表半里的病机特点。只有二者共同发挥作用，才能更好地和解少阳，消除少阳经的邪气和郁热。若单用柴胡，虽能透邪，但难以清泄里热；单用黄芩，虽能清热，但不能透散表邪。所以，柴胡与黄芩相须为用，在小柴胡汤中共同起到了关键的治疗作用，二者应共同作为君药。

综上所述，虽然对于小柴胡汤君药的认定存在一定争议，但目前主流观点倾向于柴胡为君药，它在小柴胡汤和解少阳的功效中发挥着主导和核心的作用。