小柴胡汤是《伤寒论》中的经典方剂，其应用广泛，主治多种病症。
在伤寒病方面，主治伤寒少阳证。伤寒病邪在由表入里的过程中，若处于半表半里阶段，就会出现少阳证。少阳为枢，邪气侵袭少阳，正邪分争于半表半里之间，导致气机不利。主要症状表现为往来寒热，即恶寒与发热交替出现，这是因为邪入少阳，正邪相争，正胜则热，邪胜则寒；胸胁苦满，少阳经循行于胸胁，邪气阻滞少阳经气，所以出现胸胁部胀满不适；默默不欲饮食，邪犯少阳，影响脾胃的运化功能，导致患者精神不振、不想吃东西；心烦喜呕，邪热内扰心神则心烦，胆热犯胃，胃失和降则喜呕。此外，还可能伴有口苦、咽干、目眩等症状，这是由于胆火上炎，灼伤津液，上扰清窍所致。
除了伤寒少阳证，小柴胡汤还可用于妇人伤寒，热入血室。妇人在经期或产后，正气相对虚弱，此时感受外邪，邪热容易乘虚内陷血室，出现寒热发作有时的症状。小柴胡汤可以和解枢机，使邪热外达。同时，对于疟疾、黄疸等杂病，只要病机符合少阳枢机不利、正邪分争，出现往来寒热、胸胁苦满等类似症状者，也可以使用小柴胡汤进行治疗。小柴胡汤通过和解少阳，调节人体的气机和阴阳平衡，从而达到治疗多种病症的目的。
