咽喉肿痛在针灸治疗时，需要根据不同的证型进行配穴。咽喉肿痛主要分为外感风热和肺胃热盛两种实证，以及阴虚火旺的虚证，不同证型配穴方法不同。

对于外感风热型咽喉肿痛，主穴常选少商、合谷、尺泽、关冲、廉泉、天突等。少商是手太阴肺经的井穴，点刺出血可清泻肺热，为治疗喉证的要穴；合谷为手阳明大肠经原穴，善治头面诸疾；尺泽为肺经合穴，可泻肺经实热；关冲为三焦经井穴，能宣泄三焦之火；廉泉、天突位于咽喉局部，可疏导咽喉气血。配穴方面，可加风池、外关。风池为足少阳胆经与阳维脉的交会穴，能疏风清热；外关是手少阳三焦经的络穴，又通阳维脉，可疏风解表、清热消肿，二者配合可加强疏散风热的作用。

肺胃热盛型咽喉肿痛，主穴同样选择上述部分穴位。配穴可选用内庭、鱼际。内庭是足阳明胃经的荥穴，能清泻胃热；鱼际为手太阴肺经的荥穴，可清肺泻火，两穴合用能有效清泄肺胃之热。

若是阴虚火旺型咽喉肿痛，主穴常用太溪、照海、列缺、廉泉等。太溪为肾经原穴，能滋阴补肾；照海属足少阴肾经，通于阴跷脉，与咽喉关系密切，可滋阴降火、利咽止痛；列缺是手太阴肺经络穴，通任脉，可宣肺散邪；廉泉可疏导局部气血。配穴则加三阴交、复溜。三阴交为足三阴经交会穴，能滋补肝肾之阴；复溜是肾经经穴，有滋阴益肾的功效，二者配合可增强滋阴降火的作用。

总之，针灸治疗咽喉肿痛时，准确辨证并合理配穴是取得良好疗效的关键。同时，治疗期间患者应注意休息，避免食用辛辣刺激性食物。