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苷根据苷键原子分类可将苷元分为O-苷、S-苷、N-苷和C-苷。①O-苷：苷元通过氧原子和糖相连而成的苷。根据形成苷键的苷元羟基类型不同，可将其分为醇苷、酚苷、酯苷和氰苷等，其中醇苷和酚苷较多见，酯苷较少见。
醇苷：苷元的醇羟基与糖的半缩醛羟基脱水缩合而成的苷，如毛茛苷（杀虫抗菌）、红景天苷（致适应原作用）、獐牙菜苦苷（解痉止痛）等。
酚苷：苷元分子中的酚羟基与糖的半缩醛羟基脱水缩合而成的苷。如熊果苷、天麻苷（镇静作用）、丹皮苷等。蒽醌苷、香豆素苷、黄酮苷、苯酚苷等多属酚苷。
酯苷：苷元中的羧基与糖的半缩醛羟基脱水缩合而成的苷，其苷键既有缩醛性质又具有酯的性质，易为稀酸和稀碱所水解。
氰苷：主要是指具有α-羟基腈的苷，数目不多，但分布广泛。易水解，尤其是在有稀酸和酶催化时水解更快，生成的苷元α-羟腈很不稳定，立即分解为醛或酮和氢氰酸；在浓硫酸作用下，苷元中的-CN基易氧化成-COOH基，并产生NH+4；在碱性条件下不易水解，但可异构化为羧酸类化合物。
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