秦艽的化学成分曾经是个有争议的问题。早期的研究者认为秦艽主含生物碱类成分。19

58年傅丰永等人首先从中提取分离出三种生物碱，分别命名为秦艽碱甲、秦艽碱乙、秦艽碱丙。但是后来有研究者指出秦艽中本不存在生物碱，而存在大量以龙胆苦苷为主的裂环环烯醚萜苷类，傅丰永等人所提取出的生物碱正是此类成分与提取过程中使用的氨液反应而生成的吡啶类生物碱。而且郭亚健等进行了一些实验，验证了这一观点。以后还有研究工作表明在秦艽的提取过程中，氨液浓度和提取溶媒及转化条件不同，所得生物碱的结果不同，有些文献提出似乎生物碱与苦苷类是同时存在并且有转化的关系。1 裂环环烯醚萜苷类(Secoiridiod glycosides)

龙胆苦苷(gentiopicroside) ，獐牙菜苦苷(swertiamarin)，獐牙菜苷(sweroside) ，6'-O-β-D-葡萄糖基龙胆苦苷(6'-O-β-D-glucosylgentiopicroside)，6'-O-β-D-葡萄糖基樟牙菜苷(6'-O-β-D-glucosylsweroside)，6. 三花苷(triofloroside)，7. Ridoside，8. 大叶苷A(macrophylloside A)，9. 大叶苷B(macrophylloside B)，10. 秦艽苷A(qinjioside A)。

2 环烯醚萜苷(iridoid glycoside)

哈巴苷(harpaposide)。

3 氧萘类(chromene)

2-methoxyanofinic acid，大叶苷C(macrophylloside C)，14. 大叶苷D(macrophylloside D)。

4 二氢黄酮类(dihydroflavone)

苦参酮(kurarinone) ，苦参酚I (kushenolI) 。

5 三萜类(triterpine)

a-香树脂(a -amyrin)，齐墩果酸(oleanolic acid)，栎瘿酸(roburic acid)。

6 甾醇类(sterol)

β-谷甾醇(β-sitosterol)，胡萝卜甾醇(daucosterol)，豆甾醇(stigmasterol)，β-谷甾醇-3-氧-龙胆糖苷(13 -sitosterol-3-O-gentiobioside)，β-谷甾醇-β-D-葡萄糖苷(β-sitosterol-β-D-glucoside )。

7 黄酮碳苷(flavone C-glycoside)

异牡荆苷(isovitexin )。

8 二糖(disaccharide)

龙胆二糖(gertiobiose )。

9 苯甲酸衍生物(benzoic acid derivative)

Methyl-2-hydroxy-3- (1-β-D-glucopyranosyl)oxybenzoate。